lncRNA测序-南宫28NG相信品牌力量-长链非编码RNA全转录组ceRNA测序

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lncRNA测序

lncRNA测序—研究lncRNA的差异表达如何影响生物学过程

长链非编码RNA（long noncoding RNA, lncRNA）是一类长度超过200 nt的长链非编码RNA，通过与DNA、RNA或蛋白质结合，在表观遗传、转录及转录后等水平调控基因表达。
lncRNA测序针对有参考基因组样本开展准确的lncRNA鉴定和lncRNA靶基因预测，同时提供针对测序数据中mRNA的分析，结果更全面，广泛应用于医学、农学研究领域。

应用方向

lncRNA测序适合生命体生长发育等各个阶段、部位或方面的研究。

动物
人、小鼠、斑马鱼等胚胎发育、性腺发育、肌肉发育和免疫调控生命过程研究。
植物
植物逆境响应、器官发育、生殖生长和病毒侵染等研究。
癌症疾病
肿瘤、精神疾病、代谢病、心血管病、免疫病等疾病发生与诊治研究。

诺禾优势

1. 周期快、质量好，稳定性高
诺禾lncRNA测序采用先进的国内外平台测序，并与高性能计算平台（High Performance Computing，HPC）结合，实现快速、稳定的测序数据分析及交付。交付周期<45天。
2. 方案设计专业，质控严格
诺禾lncRNA测序采用去核糖体链特异性建库方式，能够满足同时对lncRNA和mRNA的差异表达水平的分析以及lncRNA靶基因预测。从材料选取，建库测序，到数据分析，每一步都经过科学、缜密的设计，以保障高质量研究成果。

材料选取

RNA样本
≥1ug

文库构建
链特异性文库

PE150测序

信息分析
3. 项目文章以及物种经验丰富
南宫28NG相信品牌力量已经成功完成对人、大小鼠、猴、猪、羊、果蝇、家蚕、沙棘、线虫、拟南芥、水稻、小麦、玉米、棉花等等近百个物种进行非编码RNA测序分析，助力客户在Nature communications、Genome biology、 Science Advance等权威杂志发表多篇高水平文章。
- 80人
  分析团队
- 7年
  项目经验
- 2000+
  结题项目
- 1对1
  项目服务

信息分析

南宫28NG相信品牌力量lncRNA测序项目，标准分析流程：主要包括质控，比对，拼接，筛选，定量，差异lncRNA分析，差异mRNA分析，lncRNA靶向mRNA预测，功能富集等环节。该分析的核心是基因表达差异的显著性，比较两个或多个条件下的基因表达差异（例如，处理与对照），从中找出与条件相关的差异基因，进一步分析这些差异基因的生物学意义。

关联分析

1.LncRNA与mRNA关联分析
- LncRNA通过co-location或co-expression调控靶基因的表达。针对lncRNA与mRNA的关联分析，南宫28NG相信品牌力量采用对差异表达lncRNA的靶基因与差异表达的mRNA进行交集分析方法，当样本间差异表达的lncRNA的靶基因同时也是显著差异表达的mRNA时，该差异mRNA受到lncRNA直接或间接调控作用的可能性更大。（样品数 < 5时，选取co-location作用的靶基因与差异表达的mRNA进行分析。样品数 ≥5 时，则选取 co-location和co-expression作用的靶基因并集与差异表达的mRNA进行分析）

2.lncRNA与miRNA关联分析
- 当lncRNA上带有miRNA结合位点时，miRNA可与lncRNA结合影响lncRNA的功能。同时，根据ceRNA理论，miRNA可以通过RISC与lncRNA结合，指导lncRNA的降解。miRNA的靶向lncRNA预测分析，可通过生信分析软件预测差异表达的miRNA的靶向lncRNA。

3.lncRNA、miRNA与mRNA关联分析
- LncRNA具有miRNA结合位点，lncRNA通过与mRNA竞争性结合miRNA，抑制miRNA对靶基因的调控作用，从而间接地调控基因表达。基于ceRNA理论，筛选拥有相同miRNA结合位点的lncRNA-靶基因对，构建以 lncRNA为decoy、miRNA为核心、mRNA为靶标的lncRNA–miRNA-mRNA调控关系，构建ceRNA调控网络。

动植物多组学

疾病多组学

癌症多组学

微生物多组学

转录调控和蛋白多组学

表观遗传

送样建议

样品类型	送样建议	备注
新鲜动物组织干重	内脏组织、脑组织≥0.2g，脂肪、皮肤、骨头、血管等其他组织≥0.4 g	核酸不丰富部位，例如脂肪、成熟皮肤、骨头等部位建议酌情增加送样量
新鲜植物组织干重	叶片、花≥0.2g，根、茎、种子等其他组织≥0.7 g	成熟部位，例如植物茎、根、种子等部位建议酌情增加送样量
新鲜培养细胞	≥5*106 个
新采集的全血（液氮速冻)	≥3ml	血液样本送样前加入EDTA抗凝管，推荐使用BD管送样
BD采血管	≥2管
Total RNA建库起始量	总量：≥1ug	浓度：≥50ng/uL；体积：20uL ≤ V ≤120uL