16S / 18S / ITS 目标区域扩增子二代-南宫28NG相信品牌力量-DNA测序

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16S、18S、ITS等扩增子测序（二代）

16S、18S、ITS等扩增子测序（二代）一步到位检测环境微生物多样性

扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序，分析序列中的变异。
16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA，选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目标区域，
通过检测目标区域的序列变异和丰度，以研究环境微生物多样性及群落组成差异。
16S/18S rDNA为编码原/真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。
ITS分为两个区域：ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间，ITS2位于5.8S和28S之间。

应用方向

医学领域：疾病与人体微生物间关系，如代谢类疾病、消化类疾病、自身免疫性疾病、肿瘤癌症、神经类疾病及其他疾病等
环境领域：某一特定环境（雾霾、沙尘等污染环境，住宅、商场等生活环境）的微生物群落组成，有机肥发酵处理、污水治理、石油降解、水体及海洋等微生物群落分布和组成等
畜牧领域：肠道、瘤胃等微生物与动物繁殖、生长发育、营养健康、免疫和疾病治疗等的互作关系
农业领域：根际微生物与植物互作、农业耕作/施肥处理与土壤微生物群落等
生物能源：特殊功能的菌株、工程菌的开发
特殊极端环境：极端环境条件下的微生物类群研究

诺禾优势

1.读长长, 周期短, 性价比高
采用 NovaSeq 6000 测序平台。NovaSeq 6000 测序平台通量更高，速度更快，运行时间更短，周期最短可达10天
2.科学方案设计
从材料选取，建库测序，到数据分析，每一步都需要科学、缜密的设计，以保障高质量研究成果
- 60人
  分析团队
- 9年
  项目经验
- 100000+
  结题项目
- 1对1
  项目服务

信息分析

基于目标区域的测序，检测序列丰度，以充分研究环境微生物多样性和群落结构差异性。除QIIME1流程外，诺禾还实现全流程QIIME2分析，QIIME2中的插件DADA2可以修正测序错误，注释更为精准，且提供了多种可交互式图形系统展示，详细介绍见“QIIME2为你而来”

标准分析	解决问题
物种注释	物种注释及各物种丰度信息
α-多样性分析	微生物群落的丰富度和多样性
β-多样性分析	不同样本间的微生物群落及各样本差异情况
多元统计分析	寻找组间具有显著差异的物种，同时可以比较组内差异和组间差异的大小，判断分组是否有意义
CCA分析	研究物种组成与环境因子间的关系
环境因子关联分析
VPA分析
功能预测	预测样本的功能组成

高级分析	解决问题
肠型分析	肠道菌准确定位和疾病预测和治疗
贝叶斯网络图	判断微生物之间、微生物和环境、代谢物间的依赖关系
Source Tracker	样本中微生物群落来源

动植物多组学

疾病多组学

癌症多组学

微生物多组学

转录调控和蛋白多组学

表观遗传

送样建议

样本类型	建议送样量	最低送样量
土壤/污泥/沉积物/腐殖质	3g	0.5g
水体滤膜(孔径 0.22-0.45μm/直径 3-4cm)	2张	1张
拭子	3个	1个
瘤胃液/发酵液/组织液(离心有明显沉淀)	3mL，沉淀1g	1mL，沉淀0.5g
粪便/肠道内容物	2g(小鼠 6 粒)	0.5g(小鼠 3 粒)
动物/人组织	1g	0.5g
血浆	3mL	1mL
鲜奶	20mL	8mL

常见问题

1.16S测序哪个区域比较合适？
- 南宫28NG相信品牌力量提供的几个测序区域来自文献调研，但是目前并没有研究表明哪个测序区域更好。有文章研究表明土壤样本，16S V4区（515F-806R）比较适合做扩增子研究，可检测的物种多样性更丰富，并且可重复性强（PNAS. 2013. 110(16): 6548-6553.）。
2.若关注环境中的真核微生物多样性，ITS测序和18S测序哪个更好?
- ITS测序主要是针对真菌多样性的研究，注释准确度高；18S测序针对的是真核微生物，注释到的范围广，但是就真菌来说精确度相对较低；可根据研究目的合理选择测序方案。
3.扩增子与宏基因组的区别？
- 扩增子主要分为16S、18S、ITS测序，关注环境样本中的物种组成，该技术物美价廉，实用性高。宏基因组关注环境样本中的物种组成、功能组成及代谢通路等信息，该技术深入挖掘环境样本功能层面的信息。
4.样本送到公司，什么时候可以拿到结果？
- 自样本检测合格之后开始计算周期，包括建库、测序、数据分析、结题。扩增子周期共计20个自然日。