单细胞全长转录组

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单细胞全长转录组

数据展示

南宫28NG相信品牌力量使用Oxford Nanopore的单细胞全长转录组工作流程进行实验，以下是部分项目经验展示：

1.基础数据展示

下表展示了人的组织样本基于Nanopore PromethION平台测序 1 Cell后的基础数据，下机数据产出与官方数据呈现水平相当，表明样本测序质量良好。表一人组织样本单细胞Oxford Nanopore测序基础数据展示

Species	Reads	Cells	total_Gen es	total_Transcrip ts	Median Genes Per Cell	Median Transcripts Per Cell
Human	154,825,486	4,917	29,534	83,627	3509	3965

2.单细胞二代&三代细胞分群一致性分析

为进一步观测单细胞三代测序1 Cell是否能够满足细胞聚类及分群的单细胞分析需求，对拆分过滤后的高质量reads利用Seurat进行单细胞数据分析，结果表明：二代与三代数据细胞分群具有高度一致性；通过南宫28NG相信品牌力量自主开发的自动化细胞定义算法的Fast-Celltype进行细胞定义，并进行细胞占比分析，结果表明：单细胞三代测序能够很好地满足细胞分群及细胞类型鉴定等分析需求。