单细胞CRISPR

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单细胞测序

人体细胞中新冠感染相关的宿主因子的鉴定

Identification of Required Host Factors for SARSCoV-2 Infection in Human Cells

期刊:Cell
影响因子:66.85
发表单位:New York Genome Center
发表时间:2020年10月

一、研究背景

迄今为止,蛋白质组学已发现了数百种与新冠病毒蛋白直接结合的宿主蛋白,但还没有从全基因组层面上确定与新冠病毒感染直接相关的基因。本文在人肺泡基底上皮癌细胞株A549进行了全基因组规模的CRISPR功能缺失筛查 (loss-of-function-screen)来筛选新冠病毒感染宿主所需的宿主基因,使用多种细胞干扰技术(如CRISPR敲除、RNA干扰敲除和小分子抑制剂)进行验证,并利用单细胞转录组学、流式细胞仪和免疫荧光技术探索宿主基因抗病毒活性的潜在机制,有助于抗SARS-CoV-2药物的开发。

二、研究结论

本研究通过单细胞CRISPR技术确定了新冠病毒感染宿主所需的关键基因,以及宿主基因发挥功能的潜在机制,包括胆固醇合成和内体功能等,通过广泛的分析和实验方法验证了它们在感染中的核心作用。本研究为指导抗SARS-CoV-2病毒药物的开发提供了新的靶点,并对临床治疗有一定的借鉴意义。


参考文献

[1] Daniloski Z, Jordan TX, Wessels HH, et al. Identification of Required Host Factors for SARS-CoV-2 Infection in Human Cells. Cell. 2021;184(1):92-105.e16. doi:10.1016/j.cell.2020.10.030”


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