本研究针对盐生植物根部深色隔膜内生真菌Laburnicola rhizohalophila，探究其在极端环境下的基因组进化和适应机制。研究者对五个代表性菌株进行了染色体水平的基因组组装，发现了显著的基因组可塑性，这种可塑性源于染色体融合和裂变事件（染色体数变异）。通过基因组特征、系统发育关系等分析，提供了种内二倍体杂合体起源的明确证据，这些杂合体由遗传上不同的单倍体谱系融合而成。

其中一个二倍体菌株在多种非生物胁迫（如盐度、碱度、氧化和渗透压）下表现出相对于其亲本的生长优势。基因表达分析显示，在四种生长条件下，与膜甘油脂生物合成和跨膜转运活性相关的基因在杂合体中呈现超亲本上调。这些基因的上调可能增强了真菌在胁迫条件下的膜完整性和脂质积累，降低了丙二醛的产生，从而提高了耐盐性。

本研究支持了杂交引起的基因组加倍可导致极端环境内生真菌表型创新的观点。PacBio长读长测序技术在生成高质量的染色体级别基因组序列、揭示真菌基因组的复杂结构和杂合体形成机制方面发挥了关键作用。